Deklarasi NII oleh Kartosuwiryo menegaskan pemberlakuan hukum Islam. Akibatnya timbul persepsi masyarakat muslim bahwa segala tiadakan yang dilakukan NII pimpinan Kartosuwiryo berlandaskan ajaran Islam.

Jawa adalah salah satu etnik yang memiliki kearifan lokal dalam kepemimpinan. Kepemimpinan dalam masyarakat Jawa mendapat perhatian yang tinggi karena terkait erat dengan nilai-nilai ideal yang berorientasi pada dunia supranatural. Ini dapat dilihat dari adanya pandangan-pandangan tradisional yang menganggap raja sebagai pemimpin sekaligus wakil atau titisan dewa. Sebagai seorang pemimpin dan wakil Tuhan, tugas seorang pemimpin adalah menciptakan kehidupan yang harmonis antara .